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Abstract

Cutthroat trout Oncorhynchus clarkii × rainbow trout O. mykiss hybrids (hereafter hybrids) are difficult to visually distinguish from parental taxa, yet identifying phenotypic traits to separate hybrids from cutthroat trout is needed for conservation and management purposes. We compared phenotypic characteristics against genotype (using 34 species-diagnostic single nucleotide polymorphism loci) for 316 Bonneville cutthroat trout O. clarkii utah, rainbow trout and hybrids in Bear River tributaries. Our phenotypic classifications of fish were 91% accurate for Bonneville cutthroat trout but only 68% accurate for rainbow trout and hybrids combined. Classification errors based on phenotype were observed between parental taxa and hybrids but not between cutthroat trout and rainbow trout. The most useful phenotypic traits for distinguishing Bonneville cutthroat trout from hybrids were the absence of a white leading edge on the pelvic fin, the presence of fewer than 7 spots on the top of the head, and the presence of a prominent throat slash. The degree of hybridization in individual hybrids was associated with the number of spots on the top of their head. However, 16% of >F1 hybrids with a higher proportion of cutthroat trout ancestry and 6% of F1 hybrids exhibited all the phenotypic characteristics of cutthroat trout. The ability to visually detect admixture in hybrids was not related to fish length but was related to admixture level, with logistic regression model results predicting that, for individual hybrids when the proportion of alleles assigned to rainbow trout was >18% (95% CI, 11% to 26%), biologists were more than 50% likely to visually detect O. mykiss traits. While we encourage the use of genetic-based assessments for Bonneville cutthroat trout populations when feasible, our results suggest that phenotypic traits can assist in identifying hybridized populations and hybrid individuals, which will benefit the management and conservation of this species. However, our study included Bonneville cutthroat trout from only the Bear River basin, and further work is needed from the southern portion of the subspecies’ range to support or refute our findings.


Los híbridos de la trucha degollada Oncorhynchus clarkii × y la trucha arco iris O. mykiss (de aquí en Adelante híbridos) son difíciles de distinguir visualmente de los taxones parentales, pero es necesario identificar los rasgos fenotípicos para separar los híbridos de la trucha degollada con fines de conservación y gestión. Comparamos las características fenotípicas con el genotipo (utilizando 34 loci de polimorfismo de nucleótido único SNPs de diagnóstico de especie) de 316 truchas degolladas de Bonneville O. clarkii utah, truchas arco iris e híbridos en los afluentes de Bear River. Nuestra clasificación fenotípica de peces tuvo una precisión del 91% en la trucha degollada de Bonneville, pero únicamente un 68% en la trucha arco iris y los híbridos combinados. Se observaron errores de clasificación basados en el fenotipo entre los taxones parentales y los híbridos, pero no entre la trucha degollada y la trucha arco iris. Los rasgos fenotípicos más útiles para distinguir la trucha degollada de Bonneville de los híbridos fueron la ausencia de un borde delantero blanco en la aleta pélvica, menos de siete puntos en la parte superior de la cabeza y la presencia de un corte prominente en la garganta. El grado de hibridación en híbridos individuales se asoció con el número de manchas en la parte superior de la cabeza. Sin embargo, el 16% de los híbridos >F1 con una mayor proporción de ascendencia de la trucha degollada y el 6% de los híbridos F1 exhibieron todas las características fenotípicas de la trucha degollada. La capacidad de detectar visualmente la mezcla en híbridos no se relacionó con la longitud del pez, sino con el nivel de mezcla, y los resultados del modelo de regression logística predicen que, en los híbridos individuales, cuando la proporción de alelos asignados a la trucha arco iris era superior al 18% (95% de intervalo de confianza 11%–26%), los biólogos tenían más del 50% de probabilidad de detectar visualmente los rasgos de O. mykiss. Si bien recomendamos el uso de evaluaciones genéticas de las poblaciones de truchas degolladas de Bonneville cuando sea posible, nuestros resultados sugieren que los rasgos fenotípicos pueden ayudar a identificar poblaciones híbridas e individuos híbridos, lo que beneficiará el manejo y la conservación de esta especie. No obstante, nuestro estudio incluyó truchas degolladas de Bonneville sólo de la cuenca de Bear River, y se necesita más investigación en la sección sur del área de distribución para respaldar o refutar nuestros hallazgos.

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