Abstract
The use of DNA from fecal samples can allow for a better understanding of the ecology of a species without capturing and handling the animals. This is particularly useful for cryptic and elusive animals, such as bats. Being able to identify critical habitat, such as maternity roosts, for bat species in areas where they depend on abandoned mines that could be slated for closure is necessary to enact appropriate protections for such roosts. In particular, Corynorhinus townsendii commonly uses abandoned mines for maternity roosts. Further, maternity roosts are difficult to identify through visual surveys when only one or a few surveys are performed before mine closures. We have developed a method for identification of C. townsendii maternity roosts that uses fecal DNA extracted from fresh guano collected from plastic sheeting placed at a mine entrance. We provide a multiplex PCR assay to amplify a control region fragment found only in C. townsendii, as well as a Y-linked protein (DBY) to detect male C. townsendii DNA. The purpose of this study was to identify a temporal shift in the presence of male C. townsendii bats, which can be useful to identify a maternity roost. This method allows for noninvasive identification of critical habitat for this species and reduces the effort and safety risk of entering mines on the part of biologists.
El uso de ADN de muestras fecales permite comprender mejor la ecología de una especie en particular, sin tener que capturar y/o manejar a los animales. Este método es especialmente útil, cuando se trata de animales crípticos y esquivos, tales como los murciélagos. Es necesario identificar hábitats críticos para las especies de murciélagos, tales como refugios de maternidad construidos en áreas de minas abandonadas que podrían cerrarse, con el fin de adopter medidas apropiadas que protejan los refugios. Específicamente, se descubrió que el Corynorhinus townsendii suele utilizar minas abandonadas como refugios de maternidad. Debido a que, es difícil identificar refugios a través de métodos visuales cuando únicamente se llevan a cabo uno o pocos estudios antes del cierre de una mina, desarrollamos un método que utiliza ADN fecal para identificar refugios de maternidad de C. townsendii mediante la recolección del guano fresco que queda en las láminas de plástico al ingreso de una mina. Llevamos a cabo un ensayo de Cadena de Polimerasa múltiple (PCR multiplex, por sus siglas en inglés) para amplificar un fragmento de la región control mitochondrial de C. townsendii. De igual forma, amplificamos una proteína de unión al cromosoma Y (DBY) para detectar el ADN de C. townsendii machos. El objetivo de este estudio fue identificar tendencias temporales ante la presencia de murciélagos C. townsendii machos, que podrían ser útiles para identificar refugios de maternidad. Este método permite identificar de manera no invasiva el hábitat crítico de esta especie, a la vez que, reduce el esfuerzo y el riesgo de los biólogos que ingresan a las minas.
Recommended Citation
Williams, Kelly E.; Sherwin, Richard E.; VanDalen, Kaci K.; and Piaggio, Antoinette J.
(2020)
"A noninvasive genetic technique using guano for identification of Corynorhinus townsendii (Townsend’s big-eared bat) maternity roosts,"
Western North American Naturalist: Vol. 80:
No.
4, Article 4.
Available at:
https://scholarsarchive.byu.edu/wnan/vol80/iss4/4
Corynorhinus townsendii guano pellets collected outside of Piermont Mine, Nevada, and pooled for DNA extraction and amplification of species-specific CRQ DNA and DBY (male) DNA at each collection date. DBY and CRQ DNA copies/μL are reported for each of the 3 qPCR replicates performed on guano extraction.